Chương trình 1719 gặp khó khăn trong hấp thụ vốn đầu tư công cho vùng đồng bào dân tộc thiểu số và miền núi. Tốc độ giải ngân vốn đầu tư công tăng 83% vào năm 2021 nhưng giảm còn 25,6% năm 2022 do đánh giá không chính xác nhu cầu vốn thực tế. Cơ chế phân bổ nguồn lực chung cũng gây khó cho địa phương trong triển khai do điều kiện tự nhiên và kinh tế – xã hội khác nhau.
